มหาวิทยาลัยในประเทศไทยเผชิญกับความท้าทายหลายประการ เช่น การปรับตัวให้ทันกับเทคโนโลยีที่เปลี่ยนแปลงอย่างรวดเร็ว การรับมือกับการลดลงของจำนวนนักศึกษา การพัฒนาหลักสูตรให้ตอบสนองต่อความต้องการของตลาดแรงงาน การสร้างความร่วมมือกับภาคอุตสาหกรรมและชุมชน และการเพิ่มขีดความสามารถในการแข่งขันระดับนานาชาติ ทั้งหมดนี้ต้องทำควบคู่กับการบริหารจัดการทรัพยากรทางการเงินอย่างมีประสิทธิภาพและการพัฒนาคุณภาพของบุคลากรทางการศึกษา